余杭港区是杭州港的北大门，其辖区内拥有航道通航里程380公里；拥有各类码头127座，渡口4个，运输船舶1364艘，总运力24万吨。杭州港资源整合后，作为杭州地区内河港主导力量的余杭港区正积极运作，其三大主流作业区——崇贤作业区、临平作业区、仁和作业区也正积极规划建设，其中，崇贤作业区一期将于今年6月左右启用，仁和作业区一期有望年内启用，临平作业区建设将在年内启动。待三大作业区全部启用后，余杭港区将迎来港口物流和临港工业的辉煌时期。
崇贤：打造综合性物流园区
崇贤作业区位于京杭大运河东岸、杭州绕城高速公路北侧，利用京杭运河2300米岸线。崇贤作业区东侧为已建成使用的崇贤作业区进港道路及崇贤港区外围道路，两条道路可有效连接整个港区和320国道、地方道路，通过石塘立交上杭州绕城高速公路和杭宁高速公路，可进一步带动港区公路沿线的经济建设和对外开放、发展，促进崇贤作业区的发展。
2006年6月，崇贤作业区开工建设，其一期工程建设规模为开挖挖入式港池两个，新建500吨级泊位23个，设计年通过能力581万吨；工程总占地面积56.4公顷；利用岸线1700米；作业区南北大道以西为码头水工区块，以东为仓储、物流、行政办公、交易等陆域配套区块，将于今年6月投入试运营。
崇贤作业区将依托港口优势，打造现代港口物流基地。其货品定位以件杂为主，辅以部分散货。到件杂货作业量足以支撑项目设计能力时，则彻底淡出散货，完全定位于件杂货专用作业物流区。同时，该作业区在招商过程中，以钢铁生产企业、大中型钢铁流通企业和钢铁物流经营户为主，从作业、仓储起步，用2至3年时间把港区打造成集港口作业、物流仓储、加工、配送、交易于一体的综合性现代物流园区。目前，已有杭钢、和平等大型企业确定入驻意向，并准备在余杭单独注册公司经营。
仁和：专业发展危化品、油品码头
仁和作业区位于杭州市余杭区仁和镇东侧、京杭大运河西岸，利用京杭运河700米岸线，主航道水深稳定、水流平稳，河面宽度约200米，是内河大型码头非常理想的建设岸线。该作业区以危化品、油品码头为主，件杂货码头为辅，规划中间以205米范围高压线走廊作为隔离带。
仁和作业区分为两个功能区块，即散杂区和石化区。其中，散杂区一期工程于2006年年底开工建设，总占地面积40余公顷，规划利用岸线1430米，采用两个挖入式港池，拟新建500吨级泊位20个，设计年吞吐能力492万吨，有望年内启用。届时，从杭州运河钢材市场和杭州市区内搬迁过来的钢材经销商户以及在余杭、德清、临安、桐乡、海宁等地从事钢材贸易业务的经销商，预计进场交易的钢材经销商将达300家，市场钢材年交易量约300万吨，市场交易总额预计在90亿元左右。
仁和作业区南侧以油品、危化品泊位为主，将成为杭州运河港区化工集散中心。
临平：重点发展内河集装箱运输
临平作业区位于杭申线南岸，距临平作业区南侧约600米可直接与余杭区的东西大道相连，交通十分便利，具有良好的建设条件。根据规划，临平作业区将利用岸线1650米，采用挖入式港池，作业岸线3280米，陆地纵深820米至1060米，占地2135亩。
根据运量预测分析，至2020年，临平作业区年吞吐量将达650万吨，其中集装箱24万标箱、钢材110万吨、件杂货50万吨、煤炭250万吨。临平作业区建设将分阶段实施，一期工程到2010年预测吞吐量为340万吨，其中集装箱4万标箱、钢材70万吨、件杂货30万吨、煤炭200万吨。2020年以前，拟建成500吨级泊位34个，年吞吐量为585万吨，将发展成为以集装箱泊位为主、件杂货及煤炭泊位为辅的综合性港口。
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