美国次贷风暴已对部分港口吞吐量造成严重影响。根据深圳市交通局早前快速统计显示，受北美航线运输不景气影响，深圳港货柜吞吐量增长较往年同期明显放缓，今年首季，深圳港货物吞吐量达5061.7万吨，同比增长112%，其中外贸货物吞吐量3859万吨，增长14.4%，集装箱吞吐量491.8万标箱，增长8.51%。
美洲航线运输不景气具体反映在盐田国际航运。目前深圳盐田国际以北美航线为主，比重占45.2%，第一季盐田国际完成201.31万标箱，较去年同期下降5.4%，自去年第4季至今年3月，在美国经济由盛转衰，国际油价上升以及货量下滑的压力下，美国航线一改往年的旺盛气势，迫使不少国际货柜船公司在出现经营亏损后，纷纷撤船，以及减少与兼用舱位，深圳港东部港区也由此出现了挂靠的北美航线以及航班减少的情况，因而影响箱量增长。
而深圳西部港区以欧洲航线以及近洋航线为主，北美航线仅为15.5%，受冲击相对较小，赤湾港第一季完成148.2万标箱，较去年同期增长5%。招商局蛇口港区一季完成139.8万标箱，较去年同期增长42.2%。
针对深圳港东西部港区发展不平衡的状况，深圳市交通局港口处分析认为，这是因为美国次贷危机对深圳东西部港区影响不同，据表示，针对此一现象，深圳港航企业己组织相关人员深入调查研究收集有关数据信息，并制订应对措施，年内将努力增加深圳港内贸货柜与国际中转柜的比重，以减轻外贸出口柜量，尤其是北美航线出口柜量减少对整个港口业务的影响。
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